南京理工大学应用数学系是由建校伊始的基础课部的数学教师组建发展而来。二十世纪六十年代，一批北京大学、复旦大学、北京师范大学、华东师范大学等高校的毕业生是师资队伍的主体。这个师资队伍继承和发扬哈军工以“夯实学生坚实基础、培养国家栋梁之才”为己任的优良传统和作风，认真钻研教育教学方法，不断提高学术水平，持续探索改进教学艺术、提高教学质量的方法，制定了一系列人才培养和教学规范，为数学学科的成长和发展奠定了坚实的基础。二十世纪八十年代， 著名数学教育家江泽坚教授来我校工作，亲自开设系列数学课程，在提高数学学科的数学基础课程的教学水平和培养青年教师方面，发挥了重要作用，使数学学科的整体教育教学、科研水平上了一个新的台阶。进入二十世纪九十年代以后，数学学科秉承了老一辈数学教育工作者不断进取、默默奉献的精神，积极开展面向二十一世纪的教育教学改革与科学研究，以课程、学科建设为基础，深化教学改革与科学研究为动力，强化教学与科研相结合，在课程体系、教学内容、方法、手段及教材等方面进行了全方位、大力度的改革实践。学术研究历经多年的积淀已形成了几个颇具特色和实力学术研究团队。
    应用数学系是中国兵工学会应用数学专业委员会挂靠单位。 应用数学系，现有在编教师42人，教授8人（其中博士生导师4人），副教授16人。国际著名数学家林芳华教授、田刚教授是我系的名誉教授。应用数学系教师先后承担了国家“973”、“863”、国家自然科学基金、教育部博士点基金、江苏省自然科学基金等多项科研基金项目。同时，应用数学系还承担了国家和省教改专项研究项目多项。应用数学系目前的主要研究方向：非线性偏微分方程及其应用；图像处理中的数学建模、理论与算法研究；优化问题的理论与算法；几何分析；动力系统；金融数学；算子理论；代数K理论；信息安全与生物数学；控制理论等。

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